m6ADD:疾病相关m6A数据库

栏目:最新研究动态 发布时间:2022-10-17
m6ADD 是一个包含经过实验证实的m6A疾病数据和从高通量疾病m6A修饰谱中获得数据的数据库......


m6ADD 是一个包含经过实验证实的m6A疾病数据和从高通量疾病m6A修饰谱中获得数据的数据库。m6A-疾病数据包括m6A基因组位置、疾病名称、m6A蛋白、调控模式、组织/细胞系、实验方法和数据来源。 此外,该数据库还开发了一个预测与 24 种癌症相关的 m6A 调节蛋白的工具。


http://m6add.edbc.org/



l  Browse

用户可以根据基因、疾病名称和蛋白质浏览条目,并单击“详细信息”列以获取更多信息。



l  Search



用户可以通过输入关键字进行搜索。 对于“Species”:可以选择“人类”或“小鼠”,或两者兼而有之。 对于“Differential Method”:用户可以选择一种方法进行搜索。 需要注意的是,选择“Intersect(M&R)”得到的结果是基于共享同一个基因,同时保留了两种方法的结果。



l  m6A-Net

该模块是从string database中筛选出得分大于 900 的 PPI 数据。用户可以通过输入不同的 m6A 基因来获得与该基因交互的 PPI 网络。但是该模块中PPI 网络最多可以显示 30 个节点。用户还可以点击下面的按钮链接到“DAVID”网站,对生成的基因集进行功能注释。


 


l  m6A-Regulator

用户可以通过选择癌症类型和m6A调节因子来获得与特定癌症中m6A调节因子功能相似的基因列表。



点击“Network Diagram”显示PPI网络: