FDRdb：纤维化疾病相关RNA组数据库
纤维化是一种常见且严重的疾病，在许多器官中作为一种复杂的损伤存在，并引发一系列复杂的反应。核糖核酸（RNA）的失调在多种器官纤维化病例中起着重要作用。然而，对于纤维化疾病，仍然缺乏一个集成的平台。FDRdb是一个纤维化疾病相关RNA组信息和高通量数据集数据库：（i）包含8个物种中912个RNA与92种纤维化疾病之间的1947种关联；（ii）收集764个纤维化疾病数据集的信息；（iii）提供用户友好的网络界面，允许用户浏览、搜索和下载有关纤维化疾病和高通量数据集的RNAome信息；（iv）提供分析纤维化疾病表达谱的工具，包括差异表达分析和途径富集。
FDhttp://www.medsysbio.org/FDRdb
l Browse
浏览页面为用户提供了两个选项：通过RNA或数据集进行浏览。
1. 在RNA浏览页面上，包含5种类型的RNA（miRNA、lncRNA、mRNA、circRNA和siRNA）、物种、疾病和组织。
以lncRNA为例：选择“lncRNA”后，点击感兴趣的lncRNA名称，可以在页面右侧浏览lncRNA相关的纤维化疾病：
点击“details”跳转至详情页，可以查看该lncRNA在疾病中的表达情况、检测方式等详细信息：
2. 在数据集浏览页面上，“包含4个类别：数据类型、物种、疾病和组织。
以甲基化数据集为例：选择“Data Type”后，点击“methylation”，可以在页面右侧浏览相关数据集信息：
点击“details”跳转至详情页，可以查看该数据集样本数量等信息，并进行下载：
l Search
给页面可以根据RNA名称/疾病名称进行搜索：
以疾病“idiopathic pulmonary fibrosis”为例：
输入疾病名称后，选择物种（人、小鼠等）和组织（血液、肺组织等），点击“Search”进行搜索：
结果页面将展示与该疾病相关的基因、该基因在肺组织中的表达情况：
点击“detail”可以查看完整信息：
l Analysis
在该模块，用户可以上传自己的数据进行分析，获得差异表达和通路富集结果。文件格式如下：
“expression profile”
“sample class profile”
上传以上2个文件，选择物种，点击“Apply”进行分析：
分析结果包括结果摘要、差异基因聚类热图、火山图及KEGG、GO结果图。
