新型lncRNA MANTIS通过表观遗传调控促进内皮细胞血管生成
长链非编码RNA（lncRNA）可在表观遗传水平、转录水平和转录后水平调控编码基因的表达，从而控制不同的生物过程。目前对lncRNA在表观遗传水平上的调控机制了解甚少。近期，德国歌德大学医学系的Ralf P. Brandes团队发现了新型lncRNA MANTIS，并描述它在表观遗传学调控中的作用。相关研究结果以“Long Noncoding RNA MANTIS FacilitatesEndothelial Angiogenic Function”为题发表在Circulation杂志上，杂志影响因子19.3。
背景：内皮细胞的血管生成功能受到许多机制的调控，但长链非编码RNA（lncRNA）对血管内皮细胞的影响几乎没有被研究。研究人员着手鉴定新型和功能重要的内皮细胞lncRNAs。
材料：人脐静脉内皮细胞（HUVEC）和其他细胞，血管高压病人和健康肺组织，胶质母细胞瘤和健康人脑周围组织内皮细胞，猕猴血管，小鼠和大鼠动物模型。
方法：LNA-GapmeRs, siRNAs 或 CRISPR/Cas9敲除；Affymetrix Exon-Array；Illumina BeadChip Array；RNA原位杂交；RNA Pulldown；荧光素酶报告基因实验；免疫沉淀；质谱；RNA-seq;转座酶无障碍染色质测序（ATAC-Seq）和染色质免疫沉淀。
结果：发现新型lncRNAMANTIS在特发性肺动脉高压（IPAH）患者中下调，它与SWG / SNF染色质重塑复合物的催化亚基BRG1相互作用，维持持BRG1活性的ATP酶功能，调控核小体重塑。因此，MANTIS通过确保有效的RNA聚合酶II机械结合，调控血管内皮关键基因的转录。
研究思路：
1. 筛选和鉴定内皮血管生成相关lncRNA
H3K4组蛋白脱甲基酶(JARID1B)已被证明通过限制基因阻遏蛋白的表达来维持正常的内皮基因表达，作者在静脉内皮细胞（HUVEC）中敲除JARID1B，利用外显子芯片筛选血管内皮相关lncRNA。
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