m7G RNA甲基化测序服务

        m⁷G甲基化（N7-甲基鸟苷）是存在于tRNA、rRNA和mRNA 5’cap中最丰富的修饰之一，在调控RNA加工、代谢和功能方面具有重要作用。除了存在于mRNA 5’帽子位置，最近Cell、Mol Cell等杂志文章研究表明m⁷G也存在于mRNA内部区域^【1,2】，m⁷G作为一种新的表观转录组修饰在mRNA翻译过程具有重要调节作用。英拜生物可为客户提供m⁷G meRIP-seq、 m⁷G TRAC-Seq测序服务，在转录水平全面研究tRNA, mRNA发生m⁷G的片段或位点。

实验流程

研究案例
一、QKI将内部发生m⁷G修饰的转录本送入应激颗粒并调节mRNA代谢(Cell,2023)
        研究人员发现mRNA内部的m⁷G可被Quaking蛋白（QKIs）选择性地识别。通过m⁷G meRIP-seq、RIP-Seq筛选分析，作者鉴定到1000多个的高置信度m⁷G修饰和QKI结合的mRNA结合位点，这些位点具有保守的 "GANGAN（N=A/C/U/G）"motif序列。更为重要的是，在应激条件下，QKI7（通过C端）与应激颗粒（SG）核心蛋白G3BP1相互作用，并将内部发生m⁷G修饰的转录本穿梭到SG中，以调节mRNA的稳定性和翻译。QKI7通过减弱了Hippo信号通路中重要基因的翻译效率，使得癌细胞对化疗敏感。总的来说，作者发现一种RNA修饰调控新途径：QKI通过结合mRNA 内部m⁷G修饰位点从而调节目标mRNA的代谢和细胞耐药。

1、细胞质mRNA内部具有丰富的m7G RNA甲基化修饰

2、QKIs是mRNA内部m⁷G甲基化修饰的结合蛋白

3、应激条件下QKI6, QKI7与已经蛋白G3BP1结合

4、应激条件下QKI7将内部发生m⁷G修饰的mRNA运送至应激颗粒

5、应激条件下QKI7调控内部发生m⁷G修饰的mRNA稳定性及翻译效率

二、METTL1介导的Arg-TCT tRNA m⁷G修饰驱动癌基因翻译(Mol cell, 2021)
        RNA甲基转移酶METTL1催化tRNA发生N7-甲基鸟苷（m7G）RNA甲基化修饰。作者发现METTL1敲除会导致m⁷G修饰的tRNA丰度降低，并抑制致癌。相反，METTL1过表达会诱导致癌细胞生长和肿瘤进展。在分子机制方面，作者发现m⁷G修饰的tRNA丰度增加，特别是Arg-TCT-4-1，促进富含相应AGA密码子的mRNA翻译。并且单个tRNA Arg-TCT过表达会诱导肿瘤恶化。METTL1介导的tRNA修饰通过重塑mRNA "translatome "来增加促生长蛋白的表达，从而驱动致癌转化，表明该分子是一个很有前景的抗癌靶点。

1、METTL1促进肿瘤细胞生长及成瘤

2、METTL1敲除减少m7G修饰 tRNA表达水平并影响RNA整体翻译

3、METTL1/WDR4过表达促进m⁷G修饰的Arg-TCT tRNA丰度增加

4、Arg-TCT tRNA 促进肿瘤进展

样本
提供2-10ug mRNA或100ug的总RNA。

生信分析内容

• 数据过滤和质量控制

• 基因组比对（Mapping）

• Peak Calling

• Peak 注释

• Motif分析

• 组间差异Peak分析、注释

• 差异基因GO/KEGG分析