DNA甲基化检测

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简介:DNA甲基化测序RRBS,Illumina Human 甲基化450K芯片服务
提供商:上海英拜科技生物有限公司
服务名称:DNA甲基化检测
地区:上海
(1)DNA甲基化测序RRBS
Reduced Representation Bisulfite Sequencing(RRBS)是一种准确、高效、经济的DNA甲基化研究方法,通过酶切富集启动子及CpG岛区域,并进行Bisulfite测序,同时实现DNA甲基化状态检测的高分辨率和测序数据的高利用率。
研究结果充分证明了RRBS技术的可靠性。RRBS可作为一种更高效经济的研究方法,可应用于检测全基因组启动子和CpG岛区域DNA甲基化状态。
 
(2 甲基化450K芯片服务
    每张芯片包含45万个CpG 位点,24846个基因来自于CCDS,2000多个 癌症相关基因、 400 个miRNA 基因启动子区 ,300个甲基化热点区。全面覆盖基因的启动子区域、5`UTR、第一个exon、基因内部、3`UTR,全面覆盖CpG island、CpG shores、CpG shelves;并且覆盖了科学家们研究发现的一些其它重点区域,如:CpG island以外的CpG位点、在人类干细胞中观察到的非CpG岛甲基化位点、多种肿瘤样品与正常样品以及不同组织之间有差异的甲基化位点、miRNA启动子区域以及GWAS项目发现的疾病相关区域位点、FANTOM 4 启动子等。
实验流程:
1.基因组DNA;
2.亚硫酸氢盐转化;
3.VCA方式扩增、片段化;
4.芯片杂交、洗脱、延伸、成像;
5.数据分析.

(3)DNA甲基化免疫沉淀测序服务(MeDIP-seq)
   DNA甲基化 免疫共沉淀测序(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing,MeDIP-Seq)先用5'-甲基胞嘧啶抗体富集胞嘧啶甲基化的基因组片断,然后对富集的片段进行高通量测序。该方法检测范围覆盖全基因组,所需测序数据量较少,但不能在单碱基分辨率水平上检测DNA胞嘧啶甲基化状态。

研究流程示例(上图)
 
MeDIP-Seq实验流程(上图)

 
                   MeDIP-Seq数据分析流程

资料下载: illumina甲基化芯片.pdf 附件下载   DNA甲基化测序MeDIP-Seq.pdf 附件下载   DNA甲基化测序RRBS.pdf 附件下载 

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