piRNA可作为结直肠癌疾病进程的致癌调节因子和可能的预后标志物[1]
结直肠癌是世界范围内第三大常见的癌症,是第四大致死癌症。由于结直肠的高风险性和致死性,研究有效的防治方法是极其必要的。
目前,越来越多的证据显示piRNA可能是人类癌症中基因表达的重要表观调节因子,不过piRNA在结直肠癌中的功能作用以及临床意义还不清楚。因此作者对结直肠癌组织和配对正常组织(n=4)进行了smallRNA-Seq,筛选到4个显著差异表达的piRNA(piR-23619,piR-24000,piR-1245和piR-26525)。在大量结直肠癌和正常对照中进行RT-PCR验证发现piR-1245和piR-26525是显著差异表达的。同时,通过TCGA数据库查找发现piR-1245在多种癌症中都是显著差异表达的,且与结直肠癌的癌症分级、转移以及患者预后显著相关。在结直肠癌细胞系HCT-116和SW480中敲除piR-1245,抑制细胞增殖、迁移和侵袭,诱导细胞凋亡。作者通过在结直肠癌细胞系HCT-116中干扰piR-1245,基因芯片检测mRNA表达变化来研究piR-1245对结直肠癌的影响,结果发现受piR-1245影响的下游基因参与细胞生存相关通路。靶基因预测及表达分析发现,piR-1245与直接作用的靶基因(ATF3, BTG1, DUSP1, FAS,NFKBIA, UPP1, SESN2, TP53INP1和MDX1)表达显著负相关。所以piR-1245可作为结直肠癌疾病进程的致癌因子和可能的预后标志物。
研究路线:
实验结果:
图1 结直肠癌中癌症相关piRNA的临床意义
图2 在TCGA数据库中,目标piR-1245在其他多种癌症中表达显著上调。
图3 piR-1245在结直肠癌细胞系HCT-116和SW480中促进克隆形成、细胞生长、迁移和侵袭,抑制细胞凋亡
图4 鉴定piR-1245下游靶基因
图5 piR-1245及其下游靶基因在结直肠癌中的表达相关性
1. Weng, W., et al., Novel evidence for a PIWI-interacting RNA (piRNA) as an oncogenic mediator of disease progression, and a potential prognostic biomarker in colorectal cancer. Mol Cancer, 2018. 17(1): p. 16.
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