27分文章揭示lncRNA直接结合mRNA

      近年来，长链非编码RNA（(long noncoding RNA, lncRNA)）的研究热度持续升温，高分文章频出。目前，lncRNA的研究机制比较常见的是通过ceRNA机制或结合蛋白调控mRNA，而LncRNA直接结合mRNA的研究报道相对较少。下面要讲的文献（Analysis of the androgen receptor–regulatedlncRNA landscape identifies a role for ARLNC1in prostate cancer progression），研究内容只来回围绕一个mRNA和一个LncRNA之间的相互调控就发27分杂志。

首先看下机制图：

   是否惊讶27分的文献机制竟如此简单？一般的高分文章都会很复杂且涉及n多个分子！这篇文章揭示AR蛋白作用于LncRNA ARLNC1的启动子区，促进ARLNC1的转录，而ARLNC1又于AR mRNA直接结合促进稳定和翻译，从而形成一个正反馈回路。

研究路线：

1.筛选前列腺癌中受AR调控的基因

   雄激素受体（AR）在前列腺癌中起重要作用，因此作者研究AR调控的基因。通过RNA seq检测DHT处理和未处理的前列腺癌细胞（n=3）,筛选受AR调控的的mRNA和lncRNA (A). 并通过TCGA数据库筛选与前列腺癌相关的mRNA和lncRNA（B）,最后发现几个被AR正调控且在前列腺癌中上调mRNA 和lncRNA (C)

2.ARLNC1 为前列腺谱系特异性lncRNA，且在癌症中高表达

   通过整合转录组学分析发现ARLNC1差异受AR调控最明显，且在前列腺癌中特异表达，因此选为目标基因，进行下一步研究。

3.ARLNC1调控AR信号通路

   确定目标后就是研究ARLNC1的下游通路，通过siRNA干扰ARLNC1进行表达普芯片检测，功能富集后发现下游基因与AR相关，这就可能ARLNC1又反馈调控AR。

4.ARLNC1和AR转录本共定位

   接下来作者直接研究ARLNC1是否直接结合AR mRNA。首先预测两个RNA之间是否又结合位点，通过荧光素酶报告基因实验验证两者结合，通过FISH在细胞核组织中验证两个RNA转录本共定位。

1.ARLNC1作为AR阳性前列腺癌模的治疗靶点

   最后就是将通路回到体内验证