27分文章揭示lncRNA直接结合mRNA
栏目:最新研究动态 发布时间:2018-06-13
近年来,长链非编码RNA((long noncoding RNA, lncRNA))的研究热度持续升温,高分文章频出.....

      近年来,长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA))的研究热度持续升温,高分文章频出。目前,lncRNA的研究机制比较常见的是通过ceRNA机制或结合蛋白调控mRNA,而LncRNA直接结合mRNA的研究报道相对较少。下面要讲的文献(Analysis of the androgen receptor–regulatedlncRNA landscape identifies a role for ARLNC1in prostate cancer progression),研究内容只来回围绕一个mRNA和一个LncRNA之间的相互调控就发27分杂志。

首先看下机制图:

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     是否惊讶27分的文献机制竟如此简单?一般的高分文章都会很复杂且涉及n多个分子!这篇文章揭示AR蛋白作用于LncRNA ARLNC1的启动子区,促进ARLNC1的转录,而ARLNC1又于AR mRNA直接结合促进稳定和翻译,从而形成一个正反馈回路。

研究路线:

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1.       筛选前列腺癌中受AR调控的基因

   雄激素受体(AR)在前列腺癌中起重要作用,因此作者研究AR调控的基因。通过RNA seq检测DHT处理和未处理的前列腺癌细胞(n=3,筛选受AR调控的的mRNAlncRNA (A). 并通过TCGA数据库筛选与前列腺癌相关的mRNAlncRNAB,最后发现几个被AR正调控且在前列腺癌中上调mRNA lncRNA (C)

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2.       ARLNC1 为前列腺谱系特异性lncRNA,且在癌症中高表达

   通过整合转录组学分析发现ARLNC1差异受AR调控最明显,且在前列腺癌中特异表达,因此选为目标基因,进行下一步研究。

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3.       ARLNC1调控AR信号通路

   确定目标后就是研究ARLNC1的下游通路,通过siRNA干扰ARLNC1进行表达普芯片检测,功能富集后发现下游基因与AR相关,这就可能ARLNC1又反馈调控AR

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4. ARLNC1AR转录本共定位

   接下来作者直接研究ARLNC1是否直接结合AR mRNA。首先预测两个RNA之间是否又结合位点,通过荧光素酶报告基因实验验证两者结合,通过FISH在细胞核组织中验证两个RNA转录本共定位。

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1.       ARLNC1作为AR阳性前列腺癌模的治疗靶点

   最后就是将通路回到体内验证