如何使用GEPIA分析基因与癌症生存率的相关性

GEPIA是目前我国在利用TCGA数据做可视化分析上，比较著名的一款在线工具。GEPIA是一个网络服务器，使用标准处理管道分析来自TCGA和GTEx项目的9,736个肿瘤和8,587个正常样品的RNA测序表达数据。因其简洁有效具有良好的操作性，不少生信分析科研文章的文章里figure都来自GEPIA。

现在我们以“LAYN基因与乳腺癌生存率的相关性分析”为例，来演示Prognoscan的使用方法：

1.首先打开GEPIA地址（http://gepia.cancer-pku.cn/），选择“Multiple Gene Analysis”→“Correlation Analysis”

2.填写X轴和Y轴基因（这里我们都写成LAYN基因，作为演示）→“Correlation Coefficient”选择“Spearman”→把TCGA的Tumor和Normal中的癌症类型依次add到右边的“Used Expression Datasets”中

3.点击“Plot”成图

今天的分享就到这里啦，希望能帮到苦心科研的你，我们下次再见！