手把手教你使用TCGA下载临床数据

栏目:最新研究动态 发布时间:2021-01-20
如何下载临床数据?相信这个问题一定困扰过做科研的你,下面跟小编一起来Get这个技能吧!

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1. 打开浏览器搜索“TCGA GDC



2. 鼠标放置在 Repository”处就会看到出现“browse and download data”字样,说明转录组数据是在这里下载的 


3. 进入“Repository”后先看右上角“Cart”处是否为“0”,不为零的话要先清除之前下载的数据,清除方法是选择“Cart”,然后点击右下角的“Remove From Cart”。

 

4. Cart”里面的内容清除之后,点击“Repository”,开始选择需要下载的样品信息“Cases”和需要下载的文件“Files”。

 

5. 这里我们以结肠癌COAD和直肠癌READ为例,下载临床信息,首先选择样品信息“Cases”,我们这里选择的结肠癌COAD和直肠癌READ的所有信息,如果需要下载针对性的临床信息(这里我们选择结肠癌COAD和直肠癌READ的数据进行下载)可以在下拉框中自行选择





6. 然后选择需要下载的文件“Files”,这里也可以再下拉框中根据自己需要的格式进行下载

 

7. 然后将文件添加到“Cart, 即点击“Add All Files to Cart

 

8. 总共筛选出548个结肠癌和直肠癌临床数据的样本信息,进入“Cart”页面,选择要下载的格式进行下载

 

这样我们的临床数据的样本信息就下载完成了,小伙伴们如果想要学习其他数据库的使用,请持续关注呦!