Structural Signature：探索人类细胞系和组织蛋白质结构特征的在线平台

蛋白质的结构特征为了解生物学功能和相似性提供了有力的见解。之前的研究已经证明，组织和药物处理的细胞系样本的结构特征可分别用于预测组织类型和表征药物关系。Structural Signature是一个网络服务器，用于注释和分析基因组中的蛋白质特征，这些特征通常在转录组和蛋白质组数据中发现。

https://structural-server.kinametrix.com/.

l  Input

输入基因名称或 UniProt ID 列表,点击“Submit”后耐心等待几分钟：

l  Output

在结果页面，可以单击“Download Results”下载结果为csv格式：

也可以选择感兴趣的结果进行可视化：

点击“”图标可以下载结果图：

l  Date Explorer

在该页面上允许用户探索来自人类患者样本数据库的 GTEx、ARCHS4 和肺腺癌单细胞 RNA 测序数据的特征。该页面中数据既表示为交互式 3D t-SNE 图，也表示为原始值及其频率的可搜索表。t-SNE参数如下：n_components=3、verbose=1、perplexity=30 和 n_iters=250。