LiqBioer:人工管理的体液中癌症生物标志物数据库

栏目:最新研究动态 发布时间:2022-10-25
研究人员开发了LiqBioer,其中包含来自 3447 项研究的 6231 条人工整理记录,涵盖 22 个组织中的 3056 种生物标志物和 74 种癌症......


癌症生物标志物是可测量的指标,在临床应用中起着至关重要的作用。自液体活检发展以来,体液中的生物标志物引起了相当大的关注,其数据量也在迅速增加。 然而,尽管有少量小规模和特定的数据资源,但目前的研究缺乏将已发表的癌症体液生物标志物汇编成一个集中且可持续的研究人员和临床医生存储库。 为了实现这一目的,研究人员开发了LiqBioer,其中包含来自 3447 项研究的 6231 条人工整理记录,涵盖 22 个组织中的 3056 种生物标志物和 74 种癌症。

LiqBioer 允许用户浏览和下载有关体液生物标志物的综合信息,包括癌症类型、来源研究和临床使用。

http://www.medsysbio.org:8080/LiqBioer/



l  Quick Search

在Home页提供快速查询功能。用户输入感兴趣的标志物(基因名、细胞、)或疾病名称,单击回车键进行查询即可。以TP53为例:



结果页面中除显示疾病、相关药物等信息,还可以点击“PMID”查看相关文献支持:



l  Browser

该模块允许用户通过点击卡片来浏览生物标志物的不同方面,包括标志物、癌症类型、药物信息、标志物得分、其他物种相关信息。



以“Cancer Types”为例,单击该卡片跳转至以下页面,选择相应的部位,如“Brain”:



页面跳转至脑部相关的标志物详情页,点击“PMID”可以查看相关文献支持:




l  Search

与“Quick Search”相比,该模块支持更详细的搜索条件。用户可以在A区中选择物种、体液类型、临床用法及标志物类型,然后在B区中输入标志物名称或者癌症类型,点击“search”进行搜索:



结果如下所示:



l  Download

点击“Format”选项,根据需求选择下载txt或者xlsx格式即可: