ncFO：铁死亡相关的非编码RNA数据库

ncFO数据库记录了参与调节铁死亡的实验验证和预测的非编码RNA（ncRNAs）。ncFO总共记录了90个实验验证条目和3260个预测条目。同时，ncFO数据库还可以进行在线共表达分析、生存分析和差异表达分析。http://www.jianglab.cn/ncFO/

l   Search

用户可以通过铁死亡基因和三种 ncRNA（miRNA、lncRNA、circRNA）搜索所有经过实验验证的条目。

以铁死亡相关基因“ACSL4”为例，点击“Search”跳转至结果页面。搜索结果展示与ACSL4相关的ncRNA。

点击“Correlation analysis”可以查看不同疾病中ACSL4与ncRNA的相关性。

l   Prediction tools

1.用户可以通过铁死亡基因、lncRNAs或miRNAs进行搜索，获得调控铁死亡基因的miRNAs/lncRNAs。

以“has-let-7b-5p”为例，搜索结果包含基本信息、分析工具、调控网络及其详细信息。

“Analysis tool”可以进行不同疾病中has-let-7b-5p的差异表达分析、生存分析、分期分析。

2. 用户可以使用共表达分析预测与铁死亡相关的ncRNA。用户可以输入铁死亡基因、ncRNA 类型、cuttoff、分析方法并指定癌症类型。共表达分析使用TCGA 数据集。

以“GPX4”与miRNA在乳腺癌中的共表达分析为例，结果中展示了miRNA与GPX4的相关性，miRNA在乳腺癌中的差异表达、分期、生存分析结果。