CircSC使用由171项公共研究中的254590个细胞组成的全长单细胞RNA测序数据集,以生成人类和小鼠细胞中circRNA的综合表达谱。CircSC在这些scRNA-seq文库中总共识别了196491个人类和310969个小鼠的circRNAs,揭示了脑样本、发育中的胚胎和乳腺肿瘤中circRNAs的细胞类型特异性表达模式。
http://159.226.67.237/zhao/Database/circSC/index.html
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用户可以获得每个研究的详细信息,其中包括count矩阵、circRNA列表和实验元数据。
点击“Study”跳转至详情页查看、下载相关信息。对于有足够细胞进行细胞聚类分析的研究,提供每个细胞簇的标记基因,并根据原始研究中提供的元数据注释细胞类型。对于少于100个细胞的研究,只提供了circRNA列表。
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用户可以通过组织、细胞类型、GEO ID和基因组坐标、circRNA ID进行搜索。
点击“circRNA ID”可跳转至circAtlas 2.0数据库查看circRNA相关信息: