uORFdb：上游开放阅读框数据库

上游开放阅读框（Upstream open reading frames ，uORFs）由AUG或近同源起始密码子启动，并已在大多数真核转录物的转录前导序列中鉴定。在功能上，uORF参与主要蛋白质编码序列的下游翻译调节，并可能作为非标准肽的来源。uORF序列的遗传缺陷与包括癌症在内的各种疾病的发展有关。uORFdb使用户能够直接访问超过240万人uORF的序列信息、图形显示和遗传变异数据。它还包括另外12个物种中>420万uORF的序列数据。该数据库还包含从TCGA收集的677个癌症样本的全基因组测序（WGS）分析中获得的uORF相关的体细胞变异数据。

https://www.bioinformatics.uni-muenster.de/tools/uorfdb/index.pl?

该数据库中可以输入基因名、转录本ID、SNP进行查找。以按照基因名查找为例：

l  在搜索框输入基因名“M1EF1”，点击

l  与该基因相关的搜索结果“Publications”和“Genes”2项

l  点击“Publications”查看M1EF1相关的文献。点击“PubMed ID”跳转至文献页面

l  点击“Genes”查看不同物种中该基因同源基因信息：

l  选择感兴趣的物种后点击“Apply”可单独查看该物种中M1EF1的相关信息。

点击“Model”可查看M1EF1开放阅读框信息并进行下载：