DNA甲基化已成为癌症研究中一个很有前途的生物标志物。然而,确定临床相关生物标志物的准确基因组位置仍然是一项具有挑战性的任务,阻碍了癌症DNA甲基化生物标志物在临床上的应用。整合癌症相关WGBS数据为精确识别这些生物标志物提供了一种很有前途的方法。随着癌症DNA甲基化生物标志物研究的快速进展,癌症相关WGBS数据的可用性急剧增加。然而,目前没有专门的资源癌症DNA甲基化生物标志物WGBS数据。
MethMarkerDB,一个用户友好、可访问的数据库,集成了724个DNA甲基化生物标志物基因,并包含来自PubMed上发表的文章和广泛的全基因组DNA甲基化测序(WGBS)数据。该数据库提取了这些生物标志物基因中真正具有功能的差异甲基化区域(DMR),并进行了精细的分析、整合和呈现。它包含了基于文献的基因标记、DMR标记以及诊断和预后评估功能,为研究人员提供了强大的工具,以更好地了解和利用癌症DNA甲基化生物标志物。
Search
已搜索基因为例,选择癌症类型并输入基因名称,点击”Search”进行搜索即可:
结果界面显示基因的详细信息、甲基化信息、相关文献等:
Analysis
以Pan-cancer DMR分析为例,输入基因名、选择筛选标准,点击“Search”即可:
结果页面展示包含该基因的多种癌症类型: