单细胞转录组（scRNA-seq）生信分析服务

单细胞转录组（scRNA-seq）生信分析服务

服务介绍：单细胞转录组测序（scRNA-seq）是在单细胞水平对转录组进行测序的前沿技术，能够在单细胞分辨率下直接测量基因表达信息，克服传统批量测序掩盖细胞异质性的局限。该技术可识别罕见的细胞亚群、揭示细胞间的差异表达，在肿瘤研究、免疫学、发育生物学、神经科学等领域展现出巨大的应用价值。

然而，单细胞转录组数据具有高维度、高噪声、大数据量的特点，分析流程复杂、工具繁多，对研究者的生物信息学能力提出了极高要求。为帮助科研人员充分挖掘单细胞数据的生物学价值，我们推出专业的单细胞转录组生信分析服务，提供从原始数据到生物学解读的一站式解决方案

标准分析服务：

1， 从GEO等数据库下载单细胞表达矩阵文件（或者下载fastq格式序列，再匹配转换为单细胞表达矩阵文件）。

2， 根据组织类型和数据质量进行初步质控和筛选

3， 批次校正和标准化，以及聚类和可视化分析

4， 使用SingleR等软件进行自动化注释，并进行人工检查，形成可靠的细胞注释。选择最具代表性的marker生成气泡图和小提琴图，以确认注释的正确性。

5， 各个类型细胞数目的统计，并比较组间的差异。

6， 疾病与对照之间的差异表达分析，各个细胞类型之间的差异表达分析

高级分析服务：

1， 使用cellchat进行细胞通讯分析

2， 使用SCENIC进行转录因子活性分析

3， 拟时序分析

4， 指定基因集的通路得分计算。

5， 指定细胞类型的亚群分析。