空间转录组(ST-seq)生信分析服务
服务介绍:空间转录组测序(ST-seq)技术将基因表达信息与组织空间位置相结合,能够在保留组织空间结构的基础上,解析细胞组成、基因表达特征及组织微环境,为揭示疾病发生发展机制提供全新视角。然而,空间转录组数据分析流程复杂、技术门槛高,如何充分挖掘数据价值,是科研研究中的重要挑战。我们提供专业的一站式空间转录组生物信息分析服务,涵盖数据质控与预处理、空间聚类、细胞类型注释、空间差异表达分析、空间变异基因识别、细胞通讯分析、空间微环境解析,以及与单细胞转录组数据的整合分析等。
标准分析服务:
1, 从GEO等数据库下载单细胞表达矩阵文件、组织切片图片以及相关文件。
2, 根据组织类型和数据质量进行初步质控和筛选
3, 标准化、聚类和可视化分析
4, 使用单细胞数据进行反卷积计算,对空转进行细胞注释
5, 共定位分析
高级分析服务:
1, 细胞通讯分析
2, 转录因子活性分析
3, 拟时序分析
4, 通路得分计算