高分文章发表Small RNA 测序验证miRNA潜在标记物
栏目:最新研究动态 发布时间:2018-10-22
阿尔茨海默病(AD)是世界保健系统的一大挑战,生物标记物能够为AD的早期诊断提供依据, 提高病人的护理质量......

(Validating Alzheimer’s disease micro RNAs using next-generation sequencing.Alzheimer's & Dementia. 2016. IF=11.619 )

阿尔茨海默病(AD)是世界保健系统的一大挑战,生物标记物能够为AD的早期诊断提供依据, 提高病人的护理质量。研究者之前已报道过54 个AD案例和22个健康者的 miRNA测序,为对新型 AD生物标记物进一步验证, 研究者又利用Illumina HiSeq2000测序平台对49 个AD患者 和55 个健康者,以及20个轻度认知障碍病人和90个多发性硬化症病人的血液利用多重测序进行small RNA测序,每个通道测序6个样本。

研究者先将AD和对照群体的miRNA进行比较, 获得差异miRNA,并将研究重点放在当初已发表的12个miRNA标记物上;其次研究差异miRNA与临床信息如治疗的相关性;然后分析miRNA靶点获得AD miRNA的核心调控网络;最后还比较AD病人与轻度认知障碍病人和多发性硬化症病人的差异。

测序结果每一个体获得大约14 M reads数, 290个个体总共3.85 billion reads。 将AD患者与健康者比较,联合之前的研究一共发现580个差异miRNA,其中本次研究获得146个,有68个与之前的重叠。该研究验证miRNA可作为AD生物标志物, 将有助于阿尔茨海默病的及早诊断和病人护理的改善。下一步的研究可用RT-PCR等技术对这些生物标志物进行大量临床样本的筛选和验证。

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图1. 两次研究中都呈差异表达的68 个miRNA分级聚类热图。

红色个体代表AD患者,绿色代表健康者。

 

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图2. 核心调控网络。中间的14个基因,每一个至少是五个miRNA的靶标。