lncRNA与核糖体蛋白相互作用促肿瘤
癌症是导致儿童死亡的最常见疾病，神经母细胞瘤占比较大。关爱儿童健康中重要的一环就是对于致癌基因的研究。已发现lncRNA与癌症联系紧密，那么lncRNA和神经母细胞瘤会产生哪些联系呢？今天，小编带大家一探其奥秘吧。
文章思路：
结果：
1. LncNB1在MYCN扩增的神经母细胞瘤中过表达
MYCN扩增的神经母细胞瘤细胞系显示出高N-Myc，MYCNOS和IGF2BP1表达水平以及低c-Myc RNA表达水平。染色体上的lncRNA RP1-40E16.9，也称为LOC100507194和LINC02525，本文中称为lncNB1，同样高表达并显示与N-Myc、 MYCNOS非常相似的表达模式，表明该lncRNA可能是参与MYCN扩增的神经母细胞瘤的肿瘤发生。检查lncNB1在人肿瘤组织中的表达，lncNB1在人类神经母细胞瘤中升高，在MYCN扩增的胶质瘤细胞系中高表达，lncNB1 RNA表达与N-Myc mRNA表达正相关。
2. LncNB1上调DEPDC1B基因和E2F1蛋白表达
DEPDC1B可以诱导ERK蛋白的磷酸化，磷酸化的ERK是可以增强N-Myc蛋白的稳定性。lncNB1 siRNA持续降低DEPDC1B mRNA和蛋白质以及E2F1蛋白质，但未显示对E2F1 mRNA的一致作用。强力霉素治疗减少lncNB1、DEPDC1B mRNA、DEPDC1B和E2F1蛋白、不减少E2F1 mRNA表达。
3. LncNB1通过DEPDC1B上调N-Myc蛋白表达
lncNB1 siRNA转染胶质瘤细胞不会改变N-Myc mRNA的表达, 但降低DEPDC1B蛋白的表达、ERK蛋白的磷酸化、N-Myc蛋白的S62磷酸化和表达。DEPDC1B siRNA的转染效果一致。lncNB1 siRNA或DEPDC1B siRNA可使N-Myc蛋白半衰期减少约50％，加入蛋白酶抑制剂MG-132并没有增加DEPDC1B蛋白的表达，上调N-Myc蛋白表达。敲低lncNB1减少了DEPDC1B和N-Myc蛋白表达，ERK蛋白磷酸化和NMyc蛋白在S62处磷酸化。
4.LncNB1通过E2F1激活DEPDC1B基因转录
克隆DEPDC1B基因转录起始位点上游1146、545或75 bp区域到 pGL3 萤火虫荧光素酶载体，并转染该载体进入强力霉素诱导的对照shRNA、lncNB1 shRNA-1或lncNB1 shRNA-2 BE（2）-C细胞。用强力霉素敲低lncNB1降低所有野生型的荧光素酶活性，表明DEPDC1B转录起始位点上游75 bp区域对于lncNB1激活DEPDC1B基因转录至关重要。敲除75 bp区域的富含E2F1-结合位点的20 bp核苷酸废除lncNB1 shRNAs的降低DEPDC1B启动子活性作用。E2F1敲低可降低DEPDC1B mRNA和蛋白质表达。降低lncNB1表达减少了DEPDC1B基因核心的E2F1蛋白结合。过表达E2F1及其功能伴侣DP1增强野生型DEPDC1B基因启动子活性，DEPDC1B基因启动子的E2F1结合位点富集的20个核苷酸被删除后，这种效应也被废除。
5.LncNB1通过结合RPL35来诱导E2F1蛋白翻译
降低RPL35会下调DEPDC1B、N-Myc和E2F1蛋白表达，降低ERK蛋白磷酸化，降低N-Myc蛋白在S62处的磷酸化和表达。抗RPL35抗体有效降低了BE（2）-C和Kelly细胞中的RPL35蛋白，RPL35蛋白与lncNB1 RNA和E2F1 RNA结合，lncNB1 siRNA-1或siRNA-2转染可降低RPL35蛋白质与E2F1 RNA结合。lncNB1 siRNA减少了E2F1蛋白的合成，而不是全局蛋白的合成，RPL35 siRNA减少全局蛋白质，包括E2F1的表达。lncNB1敲低转移了E2F1 mRNA，减少E2F1 mRNA翻译。综合来看，lncNB1通过结合核糖体蛋白RPL35增加E2F1蛋白表达，导致E2F1蛋白质合成和DEPDC1B基因转录。
6.LncNB1诱导神经母细胞瘤细胞增殖和存活
敲低lncNB1降低了胶质瘤活细胞的数量，减少增殖，诱导凋亡。DEPDC1B siRNA，RPL35 siRNA或E2F1 siRNA转染细胞减少瘤细胞数量。敲低lncNB1减少S期瘤细胞数量，诱导凋亡。
7.LncNB1敲低导致小鼠中神经母细胞瘤消退
强力霉素诱导对照shRNA，lncNB1 shRNA-1或lncNB1 shRNA-2处理的瘤细胞，发现强力霉素诱导废除lncNB1 shRNA-1或lncNB1 shRNA-2处理的瘤细胞的克隆形成能力。强力霉素诱导的lncNB1 shRNA-1 BE（2）-C细胞异种移植到裸鼠中，当肿瘤达到50mm3时强力霉素处理，发现强力霉素抑制神经母细胞瘤进展，敲降低lncNB1可以大大提高小鼠的整体生存率。
8.肿瘤组织中的高lncNB1预测患者预后不良
lncNB1 RNA表达与MYCN扩增、N-Myc mRNA、DEPDC1B mRNA表达呈正相关，RPL35和E2F1 mRNA表达与DEPDC1B mRNA表达呈正相关。瘤组织中高表达lncNB1、DEPDC1B、RPL35和E2F1 RNA表达与患者不良预后相关。
