lncRNA与核糖体RNA

    核糖体RNA（Ribosomal RNA，rRNA）是细胞内含量最多的一类RNA，结构复杂功能强大。长链非编码RNA (Long non-coding RNAs, lncRNA)是近年来新发现的一类重要的调控分子，参与各类细胞生理和病理过程，成为许多研究者们所青睐的热门领域。rRNA和lncRNA直接会摩擦出什么不一样的火花呢？故事正在上演，跟随小编一起来看看吧。别走开，这里的故事很精彩哟。

文章思路：

结果：
1. HOXB-AS3 lncRNA在健康造血细胞和急性髓性白血病（AML）细胞中的表达
    仅NPM1mut细胞系OCI-AML3中检测到HOXB-AS3表达，六个野生型NPM1（NPM1wt）的AML细胞不表达。NPM1mut患者骨髓的HOXB-AS3表达高于NPM1wt患者或健康者，NPM1mut患者HOXB-AS3表达比NPM1wt患者增加了三倍。研究其亚细胞定位，发现细胞核部分HOXB-AS3更丰富。使用了蔗糖梯度分馏法，并在OCIAML3细胞中进行了靶向多聚体分析发现GAPDH和ACTB在低、高分子量多核糖体片段，而HOXB-AS3和MALAT1富含在游离部分。敲低OCI-AML3细胞中NPM1mut可导致NPM1mut RNA表达减少，NPM1wt mRNA表达增加，NPM1总蛋白量不变，突变型NPM1蛋白减少，NPM1mut的敲低导致HOXB-AS3 RNA丰度减少。携带人源化突变Npm1敲入等位基因（Npm1cA / +）的转基因小鼠BM细胞中lncRNA转录本Hoxb5os表达上调。

2.HOXB-AS3调节AML细胞的增殖
    OCI-AML3细胞敲低HOXB-AS3，敲低导致S期OCI-AML3细胞减少，G2 / M期细胞的增加，细胞克隆能力减弱。过表达HOXB-AS3导致增殖比例增加。

3. HOXB-AS3基因在AML患者中表达的功能意义
    三个AML患者细胞敲除HOXB-AS3降低细胞的克隆数量。把患者AML细胞植入白消安预处理的NOD-scid IL2Rgammanull（NSG）小鼠，用抗HOXB-AS3 gapmers处理对体内的HOXB-AS3进行敲低，HOXB-AS3的敲低延长异种移植小鼠的存活。Hoxb5os的破坏导致BFP阳性细胞逐渐减少。

4.ErbB3结合蛋白1（EBP1）与HOXB-AS3相互作用
    lncRNA通过与特定蛋白质相互作用来调节关键的细胞过程。使用生物素化探针来捕获HOXB-AS3 lncRNA或U1转录本，鉴定出7个候选分子，EBP1反应最强。EBP1是一种RNA结合蛋白，在核仁中与NPM1相互作用并调节rRNA的成熟。在OCI-AML3细胞核裂解物中检测EBP1-NPM1相互作用，OCI-AML3细胞敲除HOXB-AS3导致EBP1和NPM1相互作用的数量减少。

5.HOXB-AS3-EBP1-NPM1复合物调节rRNA转录
    OCI-AML3细胞中敲低HOXB-AS3导致rRNA的转录降低，RNA聚合酶I对rDNA启动子的占用减少，40S和60S核糖体亚基、80S和多核糖体形成减少，OCI-AML3细胞蛋白质合成减少。过表达HOXB-AS3则有相反效果。HOXB-AS3 的敲低减少了绑定到rDNA启动的子EBP1的数量，HOXB-AS3结合的DNA中有rDNA启动子区域的富集。

6.HOXB-AS3-EBP1相互作用的特点
    构建五个HOXB-AS3截短的变体，每个变体依次缺少〜100个核苷酸。K-562细胞中过表达HOXB-AS3wt和HOXB-AS3截短变体发现变体2与EBP1相互作用降低，变体2绑定较少的EBP1蛋白。只有完整的HOXB-AS3序列和变体1可增加rRNA的丰度和产生增殖表型。HOXB-AS3区域5的删除废除了在HOXB-AS3wt和其他截短的变体中观察到的rDNA启动子序列的富集，表示区域5是HOXB-AS3与rDNA启动子相互作用所必需。

总结：
HOXB-AS3在NPM1mut AML中的功能作用
1.健康状态：NPM1蛋白处于野生型结构，驻留在核仁中并调节核糖体的生物发生。
2.NPM1突变导致核仁中NPM1蛋白的量减少，转录rRNA的总量减少；还导致HOXB-AS3 lncRNA异常上调，HOXB-AS3与EBP1相互作用并引导EBP1进入核仁，EBP1的增加量与残留NPM1相互作用，增加转录rRNA的输出。