circExp数据库收集整理了11个不同平台上18种癌症类型的48个circRNA表达谱,鉴定了 189193 个在正常和癌症样本之间显着不同的差异表达特征的circRNA,为人类癌症提供整合和标准化的 circRNA 表达谱。该数据库分析结果可以进行批量下载。http://soft.bioinfo-minzhao.org/circexp
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用户可以通过3中途径进行搜索:circRNA名称,实验设计,宿主蛋白。搜索结果包括circRNA来源的表达谱及表达谱全部circRNA的表达信息
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用户可以根据癌症类型进行查询,可以获得circExp数据库中该肿瘤所有表达谱:
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当用户浏览某一表达谱时,点击右上角“Check probe annotation”即可获得该表达谱的注释信息及热图:
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用户可以免费下载表达矩阵、差异表达列表、探针注释信息以及GEO数据集: