CancerSCEM：癌症单细胞RNA-seq数据库

CancerSCEM数据库收集了涵盖人类20种癌症类型、总计208个癌症样本的单细胞RNA-seq数据，使得我们可以比较不同癌症类型之间的细胞成分和许多功能分子的表达，最终挖掘出一些新的优越免疫检查点，可用于未来针对特定类型癌症的临床免疫治疗。（https://ngdc.cncb.ac.cn/cancerscem/index）

l  Browe

单击导航栏中的“Project Browse”后，将显示所有收集的癌症单细胞 RNA-Seq 列表，信息包括项目 ID、癌症类型、项目所在国家、样本 ID ，样本详细信息，细胞计数，文库构建协议。

此外，表中的“Sample Details”和“Analysis”列将分别提供指向每个数据集的肿瘤样本的详细信息及其一般分析结果的超链接。

l  Search

主页快速搜索：用户可以在“Quick Search”栏输入癌症类型/基因名/基因ID进行快速搜索，将生成相应的项目/样本及其分析结果和目标基因的整体表达模式；也可以在“Keyword Cloud”中点击感兴趣的关键词进行快速搜索。

导航栏高级搜索

单击导航栏“Search”可进入搜索页面。根据右侧提示输入相应关键词进行搜索即可：

l  Online analyze

在心分析分为基因分析模块和样本分析模块。基因模块主要针对样本中基因表达、不同癌症类型中基因表达、特定样本中基因表达相关性及不同来源的数据数据集间基因表达的差异。结果数据可以进行下载。

样本分析模块包块细胞成分比较、细胞相互作用及生存分析。

l  Downloads

原始数据、基因表达矩阵、每个单细胞数据集的细胞成分和每个细胞亚型的差异表达基因列表可供下载。