PCRMs：基因组中预测的顺式调节模块和组成转录因子结合位点的数据库

顺式调节模块 (CRM)，例如增强子、启动子、消音器和绝缘子，由短 DNA 序列簇组成，转录因子（TF）与CRM中转录因子结合位点（TFBS）结合以调节许多生物过程中靶基因的表达。原则上，CRM 中 TFBS 的变异会影响同源 TF 的亲和力，导致组织中特定细胞类型的染色质修饰和靶基因表达发生变化，最终导致复杂性状的多样性，包括对常见复杂疾病的易感性。

PCRMs数据库目前包含人类和小鼠基因组中准确预测的 CRM和组成TFBS的最完整集合。https://cci-bioinfo.uncc.edu/

l  Browse Database

选择物种人或者小鼠，选择感兴趣的染色体，最后选择P值，点击“Search”进行搜索，结果页面如下：

点击“CRM ID”可以展示CRM的详细信息：

l  Functional Analysis

该模块包括3种分析：(1) 基因最接近的CRM、 (2) 基因周围给定基因组范围内的CRM、 (3) 给定TF的CRM中的 TFBS