Proteome- pI 2.0：蛋白质组等电点数据库

蛋白质的电荷是其关键的物理化学特性之一，并且与pKa解离常数有关（pKa是溶液中酸强度的定量度量）。对于蛋白质和多肽，应考虑七种带电氨基酸的可电离基团：谷氨酸（γ-羧基）、半胱氨酸（硫醇基）、天冬氨酸（β-羧基）、酪氨酸（酚基）、赖氨酸（ε-铵组）、组氨酸（咪唑侧链）和精氨酸（胍基团）。总之，所有带电基团的pKa值可用于计算分子在任何 pH 值下的总电荷或估计等电点 ( pI, IEP)，即正负电荷平衡的pH值，因此分子的总净电荷等于零。pKa和等电点估计均已用于多种技术，例如二维凝胶电泳 (2D-PAGE)、结晶、毛细管等电聚焦和质谱 (MS )。但当前蛋白质等电点数据库仍非常有限。

近期，波兰研究团队建了一个蛋白质等电点数据库：Proteome-pI 2.0（http://isoelectricpointdb2.org），该数据库相关文章刊登在Nucleic Acids Research期刊（IF=16.971），题名为Proteome-pI 2.0: proteome isoelectric point database update。该数据库囊括了来自20115个蛋白质组的单个蛋白质的等电点，21种算法预测等电点，包括超过6100万种蛋白质的pKa解离常数的预测。

    该数据库支持自主浏览和搜索。

      ProteomepI 2.0 提供了与分子量分布和跨界等电点或氨基和二氨基酸统计相关的全局分析。此类数据可用于特定分类单元的高通量分析，例如植物真菌或相互作用的蛋白质组。