LncPep：lncRNA编码肽段数据库

长链非编码 RNA (lncRNA) 是一种大于 200 个核苷酸的转录物，已被证明在多个物种中发挥强大的调节功能，通常缺乏编码蛋白质的能力。然而，越来越多的证据表明 lncRNA 能够编码在生物过程和疾病中发挥相关活性的肽。

LncPep （http://www.shenglilabs.com/LncPep/）共涵盖 39 个不同物种的883,804个lncRNA 翻译的10,580,228个肽段。肽段预测应用了质谱、核糖体分析、Pfam、翻译起始位点、RNA 位点的 N6-甲基腺苷修饰、CPC2 和 CPAT 的方法。

l  Browse

选择感兴趣的物种，如“Human”,选择编码肽预测方式，点击”Sort“后，将在下方显示该物种特定预测方式下所有编码肽段的lncRNA。

点击结果中蓝色的信息，可以获得lncRNA/肽的详细信息。

l  Validated

该模块展示了有文献支持的编码肽的lncRNA，点击PMID可以跳转到文献。

l  Search

该模块提供了4种搜索方式：通过lncRNA/宿主基因/染色体位置/编码预测方式进行搜索。

l  Predict

输入1000bp以内的fasta格式lncRNA序列，选择相应物种，点击“Predict“,将在下方显示预测结果：

l  Blast

输入1000bp以内的fasta格式lncRNA序列或者肽，选择相应物种，点击“Blast“,将在下方显示预测结果，点击”link“查看详细信息：