APASdb: 选择性多腺苷酸化数据库

选择性多腺苷酸化（APA）在从原核生物到真核生物的基因表达调控中发挥着基本作用，使单个基因能够编码具有不同编码蛋白和/或3'-非翻译区（3'-UTR）的多种mRNA变体，并可能影响mRNA的定位、稳定性和翻译效率。根据细胞和组织类型和/或加工时的生理和病理条件，越来越多的基因被证明会经历如此重要的3'-加工，因此迫切需要构建关于APA的全基因组数据库，以更好地理解特定生物学的poly（A）位点选择和APA指导的基因表达调控。

APASdb数据库具有可视化所有基因在全基因组范围内不同APA亚型的精确图谱和使用量化的功能。

http://ac.agrogene.ac.cn/utr/

Search

在搜索模块中，通过选择特定物种（人、小鼠、斑马鱼）后，可以使用基因ID、基因名称、符号和模糊描述等关键字进行直接查询。以人乳腺癌CXCL12基因为例：

在结果页面，点击可以展开具体信息，在基因组中浏览APA位点：

点击，跳转到该位点详情页，可以CXCL12在不同细胞中的具体信息：

Browse

该模块在线提供与基因组、基因、转录物和转录物注释相关的APA站点的交互式和动态浏览。提供了概览、区域和细节等三个层次的选择性视图，用于浏览几个参考基因组中的APA位点：

BLAST

该模块用于输入特定序列进行APA位点的预测：