BLAB2CancerKD:乳酸菌与癌症数据库

栏目:最新研究动态 发布时间:2023-08-30
该数据库使用7794篇乳酸菌癌文献作为源数据,处理了16543个生物医学概念和23091个关联......

       癌症是一种某些细胞生长失控并扩散到身体其他部位的疾病,是全球人类死亡的主要原因之一。研究表明,乳酸菌(LAB)可以调节人体肠道菌群,提高胃肠功能和身体免疫力。近年来,LAB在癌症治疗中的潜力引起了人们的关注。
       该数据库使用7794篇乳酸菌癌文献作为源数据,处理了16543个生物医学概念和23091个关联。构建了一个包含31434条结构化数据的本体。BLAB2CancerKD以各种数据呈现形式直观、清晰地呈现了所有相关知识,交互系统功能也使其更加高效。
       http://110.40.139.2:18095/

  • BLAB2CancerKG module 1 (adjustable category display)

       该模块主要以数据显示为主。用户可以搜索“concept”或“association”来获得KG,然后单击标签图例来隐藏或显示不同类别。该模块支持csv、.JSON和.PNG格式的图片导出。

  • BLAB2CancerKG module 2 (adjustable search object)

       用户通过搜索获得结果图后,可以通过点击“switch layout”按钮在两种不同的KG显示形式之间切换,并支持.CSV格式的数据下载。


       此外,可以点击一个节点,以该节点为中心节点查看KG,并同时提供谷歌搜索和NCBI搜索。

  • BLAB2CancerKG module 4 (focus on cancer)

       该模块只显示与癌症相关的乳酸菌信息,提供了占最大比例的八个肿瘤类别的子图。

  • BLAB2CancerKG Ontology Data Sheet

       该模块以列表形式显示所有BLAB2Cancer本体结构数据,提供搜索和数据导出功能,并提供PubMed链接用于可追溯性验证。

  • Text annotation module

       本模块包括所有与乳酸菌和癌症相关的7794篇科学文献摘要。用户可以通过PMID或关键字搜索相应的文献摘要。该模块突出显示了所有相关的生物医学概念,当光标放在相应的实体概念上时,可以看到相应的类别和NCBI_ID。