越来越多的证据表明,非编码RNA(ncRNA),如lncRNA、circRNA和pri-miRNA,可以编码蛋白质或肽。ncEP是一个用于收集ncRNA编码的蛋白质或肽的数据库,这些蛋白质或肽已通过发表论文中的低通量实验进行了验证。ncEP包含由ncRNA编码的蛋白质或肽的特征,如名称、序列、物种、基因组位置、组织或细胞系、实验方法、数据源和其他详细信息。http://www.jianglab.cn/ncEP/index.html
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用户可以使用ncRNA名称、ncRNA编码的蛋白/肽名称、染色体位置进行搜索。
以ncRNA名称为例,选择感兴趣的ncRNA点击“Search”:
结果页面展示编码蛋白/肽的长度、文献来源等信息:
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用户可以通过选择感兴趣的物种,浏览特定物种中已发表的ncRNA编码蛋白/肽。
以human为例,点击“more”可以浏览具体信息:
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选择感兴趣的物种(人/小鼠/果蝇)后,选择特定的蛋白/肽,可以浏览蛋白/肽在基因组中的信息: