高分文章思路解读--lncRNA和miRNA的最新调控机制
栏目:最新研究动态 发布时间:2017-10-23
随着非编码RNA研究成果的不断涌现,要发高分文章就需要寻找新的模型、研究最新的机制......

lncRNA和miRNA的最新调控机制--高分文章思路解读

 

随着非编码RNA研究成果的不断涌现,要发高分文章就需要寻找新的模型、研究最新的机制。目前 lncRNA染色质调控和ceRNA机制的研究比较成熟,然而其作为miRNA cluster前体在肿瘤及耐药上的作用研究还比较少。近日(10月16),范德堡大学的研究者在Nature Medicine(IF=29.8)上以“lncRNA MIR100HG-derived miR-100 and miR-125b mediate cetuximab resistance via Wnt/β-catenin signaling”为题,报道了lncRNA作为miRNA cluster前体,诱导癌症耐西妥昔单抗(cetuximab)的新机制。

亮点:

1、首次发现lncRNA MIR100HG 及其衍生的miR-100, miR-125b在药物耐药中的作用。

2、miR-100 和miR-125b cluster的协同耐药作用。

3、GATA6和MIR100HG/ miR-125b的负调控回路。

研究思路:

1、3D细胞培养构建耐药细胞模型:作者使用3D细胞培养系统将cetuximab敏感的结直肠癌细胞连续4个月暴露在cetuximab中,获得耐药细胞。

2、筛查耐药相关基因:作者对耐药和非耐药CRC细胞进行全外显子测序、全转录组测序和small RNA 测序,最后发现lnc MIR100HG、mir - 100和mir - 125b在耐药细胞中上调。作者发现lnc MIR100HG是mir - 100和mir - 125b的宿主机因, 随后利用qPCR、 FISH、TCGA数据库和不同耐药程度细胞检测表达,验证这几基因在耐药中上调。

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